המסלול במוסיקה מזרחית לתואר שני מיועד לסטודנטים, מבצעים, יוצרים ואנשי חינוך מוזיקלי המעוניינים להעמיק את ידיעותיהם במוסיקה הערבית והמזרחית, הן מן ההיבט הביצועי והן מן ההיבט התאורטי, ההיסטורי והתרבותי. המסלול מאפשר הרחבה והעמקה בלימודי מקאם, מסורות ביצוע, אילתור, אסתטיקה של המוסיקה הערבית, והקשרים שבין מוסיקה מזרחית למסורות מוזיקליות נוספות.
במהלך הלימודים נחשפים הסטודנטים למגוון קורסים העוסקים במוסיקה הערבית והמזרחית מזוויות שונות — ביצועיות, מחקריות, היסטוריות ובין־תחומיות. בין הקורסים המוצעים בתשפ״ו: שילוב הפסנתר במוסיקה הערבית, עקרונות אסתטיים באמנות ערבית – בין מחול למוסיקה, והמוסיקה של האחים רחבאני בין שתי יבשות. נוסף לכך, עשויים להיכלל בלימודים סדנאות אילתור במוסיקה ערבית, היסטוריה של המוסיקה הערבית, סוגיות בביצוע מוסיקה מזרחית, ועיבוד והלחנה להרכבים מזרחיים.
