האקדמיה למוסיקה ומחול בירושלים חברה בארגונים בינלאומיים רבים. ביניהם ניתן למנות את ארגון הקונסרבטוריונים ובתי ספר למוסיקה (AEC), הרשת הבינלאומית לשיתוף פעולה אמנותי (NICA), שבין חבריה מוסדות לימוד בארה"ב ובאירופה. החברות בארגונים אלו מאפשרת פיתוח קשרים ותכנונים פרוייקטים משותפים, כגון חילופי סטודנטים ומורים, לימודי קיץ, כיתות אמן, והופעות משותפות לאקדמיה למוסיקה ולבתי ספר מובילים באירופה.
בין שאר מוסדות הלימוד עמן שומרת האקדמיה על קשר מתמשך ניתן לציין את בית הספר הגבוה ללימודי מוסיקה (ברלין), הקונסרבטוריום הלאומי (פריס), בית הספר למוסיקה Guildhall (לונדון), האקדמיה המלכותית למוסיקה (לונדון), האקדמיה למוסיקה ע"ש פרדריק שופן (פולין) והאקדמיות למוסיקה בקרלסרוהה וברוטרדם.
סטודנטים הלומדים בשנים ג', ד' וכן תלמידי תואר שני יכולים להגיש את מועמדותם לחילופי סטודנטים עד סוף חופשת הסמסטר הראשון. ועדה מיוחדת דנה בבקשה ובוחרת במועמדים המתאימים לחילופי הסטודנטים. בכל שנה, סטודנטים שנבחרים לתוכנית החילופים מבלים סמסטר אחד לפחות באחת מהאקדמיות למוסיקה או למחול באירופה. סטודנטים של האקדמיה משתתפים גם בפרויקטים של תזמורות ומקהלות בינלאומיות באירופה.
שיתופי פעולה בינלאומיים:
1. הסכמי שיתוף פעולה במסגרת פרויקט "ארסמוס +" (+Erasmus) של האיחוד האירופי: לאקדמיה למוסיקה ולמחול בירושלים הסכמי שיתוף פעולה עם מוסדות רבים בחו"ל. השנה זכתה האקדמיה להיכלל לראשונה בשני מענקי שיתוף פעולה במסגרת פרוייקט "ארסמוס +" של האיחוד האירופי, המאפשר למוסדות מחוץ לאיחוד להנות מתקציבי שיתוף פעולה במסגרת הסכם עם מוסד אירופאי. קטגורית "ניידות" (Mobility) מעניקה תקציב ספציפי לתמיכה בחילופי סגל וסטודנטים, וההסכמים שנחתמו הם עם שני מוסדות מצויינים בהונגריה - בתחום המוסיקה נחתם הסכם עם האקדמיה ע"ש ליסט בבודפשט, וזהו נדבך נוסף במערכת היחסים הפוריה שיש לאקדמיה שלנו עם מוסד מצוין זה, ובתחום המחול - עם האקדמיה למחול בן זמנו בבודפשט.
2. פרוייקט ירושלים - המבורג: באוקטובר 2015 קרם עור וגידים פרוייקט משותף לאקדמיה עם בית הספר הגבוה למוסיקה בהמבורג. פרוייקט זה, במסגרת חגיגות 50 שנות יחסים דיפלומטיים ישראל-גרמניה, שפעילותו החלה כבר בפברואר 2015 כינס 3 סטודנטים לקומפוזיציה מכל אחד מהמוסדות לכתיבת 6 מיניאטורות לסולן עם תזמורת סימפונית. מורי הסטודנטים השתתפו אף הם והיו מעורבים בהנחיית הסטודנטים משני המוסדות באמצעות טכנולוגיית אינטרנט (סקייפ). שש היצירות נוגנו בקונצרטים בהמבורג ובבאר שבע במסגרת קונצרטים משותפים לסינפונייטה באר שבע ו"תזמורת הסימפונית של העמים", שתיהן בניהולו המוסיקלי של מאסטרו יוסטוס פרנץ, ועליהן ניצח המנצח הישראלי הצעיר המצוין יואל גמזו.
3. פרוייקט ירושלים – בודפשט: פרוייקט שיתוף פעולה במוסיקה קאמרית של האקדמיה למוסיקה ולמחול בירושלים עם האקדמיה על שם ליסט בבודפשט התקיים שם בפברואר 2016 בהצלחה רבה. 28 המשתתפים וצוות ההוראה משתי האקדמיות קיימו שבוע אינטנסיבי של חזרות, והתוכנית האמנותית בוצעה בשני קונצרטים: אחד – בבית הכנסת היהודי היפהפה בעיר גיוֹר, והשני – באולם הקונצרטים ההיסטורי המחודש של האקדמיה בבודפשט בנוכחות נשיא הונגריה ורעייתו. בדברי ברכתם בקונצרט זה, ציינו נשיאת האקדמיה בבודפשט, ד"ר אנדריאה ווּג, ונשיא האקדמיה בירושלים, פרופ' ינעם ליף, את יוזמתו, מעורבותו ותמיכתו של שגריר ישראל בהונגריה, מר אילן מור, בפרוייקט חשוב זה. חברי סגל האקדמיה שהשתתפו בצוות ההוראה הם הוויולן צבי כרמלי והפסנתרן ירון רוזנטל, וכן פרופ' ליחי בן דיין, שבא לבודפשט לתת לסטודנטים כיתת אמן בכינור; הצוות ההונגרי כלל את הכנרת מרתה אברהם, הקלרניטיסט ז'ולט סטמרי והמנצח ברנבס דוקאי.